Karierę piłkarską rozpoczynał w Unii Racibórz i Odrze Wodzisław jako obrońca. W barwach Stali Mielec i Legii Warszawa występował w 1. lidze. W 1975 roku wyjechał do Stanów Zjednoczonych, występując m.in. w Los Angeles Aztecs, a następnie grał w Niemczech.
Po zakończeniu kariery piłkarza Franciszek Smuda zapracował na miano trenerskiej legendy. Pracę szkoleniową rozpoczął od prowadzenia drużyn występujących w niższych ligach niemieckich, a pod koniec lat 80. wyjechał do Turcji, gdzie trenował Altay Izmir i Konyaspor. W 1993 roku powrócił do Polski i objął posadę trenera Stali Mielec.
W 1995 roku został szkoleniowcem Widzewa, z którym zdobył swój pierwszy tytuł mistrza Polski. W sezonie 1996/1997 jego drużyna po dwumeczu z Broendby Kopenhaga awansowała do fazy grupowej Ligi Mistrzów. Łódzkim piłkarzom pod Jego wodzą udało się ponownie sięgnąć po tytuł mistrza w następnym roku.
Po zakończeniu sezonu 1997/98 Franciszek Smuda został trenerem Wisły. Stojąc na czele krakowskiej drużyny zdobył z nią w roku 1999 kolejny tytuł mistrza kraju. We wrześniu tego samego roku, mimo udanego startu w nowym sezonie, po zaledwie jednej porażce został zdymisjonowany.
Wrócił do Wisły po okresie pacy w Legii Warszawa, w czerwcu 2001 roku, przejmując drużynę, która zdobyła mistrzostwo pod wodzą Adama Nawałki. Rywalizację o awans do Ligi Mistrzów zespół Wisły przegrał z Barceloną, zaś w Pucharze UEFA na drodze "Białej Gwiazdy" stanął Inter Mediolan. W marcu 2002 roku, po ligowych porażkach z Polonią Warszawa i Legią, Franciszek Smuda został zastąpiony przez Henryka Kasperczaka.
Po raz trzeci został zatrudniony w Wiśle w latach 2013-2015. W lipcu 2021 roku został trenerem występującej w klasie okręgowej Wieczystej i zdobył z nią awans na szczebel czwartej, a następnie trzeciej ligi. To było jego ostatnie miejsce pracy w Krakowie, już wtedy walczył z ciężką chorobą (nowotwór krwi), która utrudniała Mu wykonywanie obowiązków.
Franciszek Smuda urodził się 22 czerwca 1948 roku w Lubomi, zmarł w nocy 18 sierpnia 2024 roku w Szpitalu Uniwersyteckim w Krakowie.